En el año 1935, Monseñor Guido Beck de Ramberga, Vicario de la Araucanía, funda la Misión de Futrono, el primer sacerdote a cargo de ella es el Padre Capuchino Leodegario Von Kronnwinkle. Junto a él llegan las Hermanas Misioneras Catequistas de Boroa.
En 1937 con la llegada de 4 religiosas se creó el Convento de las Hermanas Franciscanas del Sagrado Corazón. Dos de ellas se dedicaron a la educación, una a la atención de la casa y la otra Hermana a la Catequesis y atención de los enfermos. Este mismo año se inicia el internado femenino, en la escuela se cuenta con dos salas de clases donde funcionan 4 cursos (combinados).
A contar del año 2008 la Administración del colegio pertenece al Centro de Estudios San Ignacio, y está a cargo de su Director y Representante Legal don Héctor Raúl Sepúlveda Coccio.
A partir del  año 2009 se incorpora la Educación Media, de esta manera la formación de los alumnos y alumnas que ingresan a este establecimiento abarca desde Pre Kinder a 4º año de Educación Media, de esta forma pasa a llamarse “Colegio María Deogracia”.
En la actualidad cuenta con una plana Docente y de Asistentes de la educación de 60 funcionarios, todos comprometidos con la educación integral, dando gran importancia a la formación de valores, cuidado, protección y bienestar de los estudiantes.

    Rol importante dentro de la comunidad educativa está asignada a los padres y apoderados, ellos constituyen un pilar fundamental dentro de la estructura organizativa de nuestro colegio.

Los logros obtenidos en las últimas mediciones de calidad de la educación nos ubican en lugares de privilegio y ello da muestra de nuestro  compromiso con la comunidad de Futrono y nos compromete a seguir avanzando en el desarrollo de mejores aprendizajes, formando personas cristianas, humanistas, solidarias y respetuosas de Dios y el prójimo. Ciudadanos comprometidos y al servicio de la sociedad.